“至于为什么罗马教廷对待克吕尼派和清洁派的态度却大相径庭。这主要还是跟两个派别的教义主张有关。
克吕尼派同样也是因为不满教会的腐化堕落而兴起，但他只主张教士清贫、禁欲、不得买卖圣职等个人操守问题，并未触及到基督教义的核心，同时克吕尼派反对世俗王权对教会的干预，所以天主教会不但不会镇压克吕尼派，还要利用克吕尼派对抗世俗王权和诸侯势力。
而清洁派的教义则完全触及到了基督教义的核心，甚至可以说是一种迥然相异的教派。
清洁派的教义主张
上面我们提到了清洁派起源于摩尼教和诺斯底派，这两个教派都主张善恶二元论，即认为这世界存在善和恶两个神。因此清洁派也信仰两个神，一个是创造精神世界的善神，一个是创造物质世界的恶神。他们认为物质世界的一切都是由恶神创造的，所以整个物质世界都是恶的。而人的灵魂被恶神囚禁在肉体之中不得解脱，即便死去也只是轮回到另外一具肉体之中。
而基督教义的核心就是一神论，而人死后灵魂会进入彼岸天国，清洁派这种“歪理邪说”自然要被正统基督教斥为异端。
除此之外，清洁派否认了耶稣的神性，不承认基督有物质的肉体，也不承认耶稣受死，认为人得救不是靠基督的血，而是靠服从基督的教导。也就是说清洁派反对基督教的另一个核心教义，即上帝道成肉身和死后复活。
上面这两点是清洁派与传统基督教在教义上的矛盾。接下来，这些主张就触及到了天主教廷的统治地位。
清洁派认为教会已经被物质所腐蚀，根本不是上帝的代理人，因此不具备举行圣事的权利，教会资产和教阶制度也是不合理的。
既然教会不具备行圣事的权利，那由谁来举行呢？清洁派发展出“完人”这一新概念。所谓“完人”就是遵守清洁派戒律完美的人，节欲、守戒、诚实、苦修。完人可以主持礼拜、讲道、从事施舍救济以及成立学校等，也就是说完人取代了教会的权力。
所以清洁派的教义主张不但有悖于传统基督教的核心教义，而且也触动了教会在教俗两方面的统治地位，因此阿尔比派初露苗头便被罗马教廷列为异端。而且阿尔比派发展迅速，完人的苦修禁欲很容易引起底层民众的同情和爱戴，因此罗马教廷对阿尔比派的发展深恶痛绝，欲除之而后快。
法国北部一位教会僧侣曾这样说：“阿尔比派的错误发展得如此壮大，在短短的二十年内就影响了一千座城市，如果不用信仰之剑将其消灭，我确信，它会使整个欧洲都腐化!”虽然这位僧侣明显地言过其实，但仍可见清洁派对当时人们信仰带来的震动。
教廷对清洁派的镇压
上面我们提到阿尔比派虽然发展迅速，但主要集中在法国南部地区。究其原因，一方面在于法国南部与统治西班牙的阿拉伯相邻，深受阿拉伯文化影响，且此处位于地中海贸易圈，多种民族文化在此汇聚，很容易诞生新的思想流派；另一方面在于当时法王主要统治法国北部地区，南部地区相对自由宽松，且相对分裂的诸侯势力给了阿尔比派发展壮大的契机。”