瑞被刺杀身亡！
当时弗瑞将最信任的特工菲尔科尔森找了回去，两人有了一段谈话。弗瑞对科尔森开诚布公地说出大溪地计划的事，而科尔森也心结尽解，全心全力去帮助弗瑞收复失地，还贡献出他本来不想动用的几件在作为独-立小分队时与队员们找到的超自然武器。可是那一天晚上，科尔森队伍里一位曾经的成员，格兰特沃德，这位因为出现在公布的九头蛇名单上而且与确认为九头蛇的“灯塔”前长官加勒特关系密切，而被关了起来的疑犯，竟然找到了机会脱困，并趁着弗瑞休息的时候连对后者开了三枪。沃德在内间的接应下成功离开，而弗瑞也在随后被确认死亡……
这一个意外，导致了本来聚集在弗瑞旗下特工们分裂成两派。一派是以科尔森为首，准备秉承弗瑞生前志愿，打击九头蛇并保护人们。而另一派则是弗瑞的副手玛丽亚希尔为代表，她认为神盾局的局面萎靡到这种程度，已经没有存在的必要了。打击九头蛇和保护人们的办法，并非一定要留在神盾局，并非一定要勉强维持这个名存实亡的旗号。
没想到，最终神盾局在九头蛇由暗转明之后，再一次陷入分裂。
神盾局和九头蛇的故事，成为了人们茶余饭后的话题。另一个与氪星人入侵地球相关的消息却被掩盖了起来。在那场危机的最后，收割者外星人的倒戈也是一个重要的因素。不少人——主要是那些政客——都想知道超人是怎么跟收割者的虫后谈判的。然而这件事连超人本身都不清楚，而他又不想指证出显然没打算露面的佐罗（说起来他还不知道佐罗是谁），因此回避了这个问题。只是军方的一些人可不打算放弃，因为在彻底离开地球、离开太阳系之前，收割者外星人突然从军方手上抢走了好几具氪星人的尸体！
在佐德死了之后，他的那些还活着的手下全部选择了自尽。这一度让军方大感可惜。不过，氪星人的尸体也有不少的研究价值，军方也只好勉强接受了。可是现在竟然有人从他们虎口夺食，而他们偏偏奈何不了对方。先不说地球人就不一定能打得过收割者，人家已经离开太阳系了呢！而想要找相关的人出气吧，偏偏与超人的关系又在蜜月期，不太好也不值得因为这个而翻脸。而且超人毕竟也是氪星人，而且是最后一个活着的氪星人，与他讨论氪星人的尸体显然是自讨没趣。最后，只能不了了之了。
不过军方那边有一点想错了，超人可不是最后一个活着的氪星人……