进兵（本意其实就是想避开日军），结果同日军一经交手，便全军溃散，一路狂奔的跑回了台南，从此便龟缩于城中，紧闭城门不出。彭柏文等人屡次请求出战，都被刘璈以“兵力不敷”和“贼军势大，台南重地亦需布防”为由推脱。
刘璈在台南的“布防”工作主要有两大方面，首先是号称要“赶募大支游击之师”，用来加强台南的防务，但他实际上只草草募集了几营外，就再没有更多的作为了；其次是要“增添炮械”，但除了临时从外国掮商手中买了些旧枪之外，也没有了下文。
事实上，在林义哲率舰队到达台湾之后，便曾派人给刘璈送去公文，要求他加强台南各地的防御，并派军支援，但刘璈对此没有任何的回应，甚至于在淮军登陆之后，唐定奎给他发文请求支援粮草民夫，结果依然是杳无音信。
刘璈在台南当起了缩头乌龟，但日本人却并没有和他一样。
在同刘军有过一次接触之后，日军将领可能是意识到了台湾防军随时会出现，为了防止清军集中兵力发动进攻，日军开始四处出击，袭击清军各处防地，结果各处清军或因消息不通未能准备，或因兵力单薄，纷纷被日军击溃。
见到防守台湾的清军轻易的就被击败，日军胆气日壮，便在汉地大肆烧杀抢掠，无辜民众惨遭涂炭，各地乡绅见状，一边组织民团抗击日军进犯，一边不断派人向台南府求救，但刘璈一概的置之不理，终日在府中研究风水五行“破敌之策”。
“那刘璈终日躲在台南府城之中不出，任由倭寇屠戮百姓，我等亲往台南府面见刘璈，请求发兵，拯民于水火，他刘璈竟称疾不出，拒不见我等，见我等留此不去，竟然派人递话，称‘倭寇剽掠完毕，自会散去’！林大人，您说，这还是人话么！”一位年纪比较大的乡绅说到这里，浑身哆嗦不已，显然已经气极。
听完大家的控诉，林义哲的脸色已然变得铁青。
“开船，去台南。”林义哲转头对张成说道。
“大人，您这是要……”张成注意到了林义哲的脸色，小心的问了一句。
“去抓刘璈，交朝廷治罪！”林义哲看着张成，“有什么问题吗？”
“标下……领命！”张成犹豫了一下，还是大声的答道。
“怎么回事？‘威远’这是要去哪里？”
“和硕公主”号巡洋舰上，邓世昌注意到了已然起锚准备开拔的“威远”舰，不免有些摸不着头脑。
“不知道，刚才看着过去了一艘小艇。”一位军官答道，“大人还在‘威远’上，可能是临时有什么事儿吧？”
“发信号问问他们，要去哪里？”邓世昌想了一下，说道。
很快，“和硕公主”号发出了旗语信号，不一会儿，“威远”舰的桅杆上便升起了答语。
“他们要去台南府？去台南府做甚么？”邓世昌看见了“威远”的答语，不由得很是奇怪。
“再问他们，何故前去台南？需本舰同行否？”邓世昌看到“威远”升起了林义哲的将旗，更加奇怪，接着命令道。
“去台南缉贼，不必同行。”
“威远”舰又升起了回答的旗语。
“缉贼？什么意思？”邓世昌看到这个词，更是莫明其妙，“莫不成那边出了盗贼？”
“可能是吧……”邓世昌身边的几位军官也都是一脸诧异的表情。
而就在这时，“威远”舰汽笛长鸣，开始加速驶向外海。
台南，安平港，海岸炮台。
“看！那边！有军舰过来了！”
炮台上，一名炮手忽然发现海面上出现