秦朝中央官制的最大特征是皇权的至高无上。强大的君权以及对旧公族的特权的不断削弱，也是秦国最后取代在文化上优越的其他各国而统一中国的一个很重要的原因。秦王赵政[1][2]称始皇帝后，建立了由丞相、御史大夫、太尉、九卿等组成的中央政府，辅佐皇帝管理全国军政事务。
丞相
丞相是最高的行政官，上承皇帝诏命，下统百官，总揽政务。（《汉书·百官公卿表》：「相国、丞相，皆秦官，金印紫绶，掌丞天子助理万机。」）秦国丞相之设始于秦武王二年，是年设左、右丞相，秦昭王三十二年，改相邦（汉代讳为“相国”）。秦王赵政[3][4]未亲政时，以吕不韦为相邦，并置丞相昌平君，期间或左右二相并置、或设独相、或称相邦。秦始皇统一全国后，以李斯为左丞相，冯去疾任右丞相。秦二世诛李斯、冯去疾，以赵高为中丞相。秦制，出任丞相的人均受封侯爵。
御史大夫
秦创置御史大夫，掌监察百官，为副丞相。（《汉书·百官公卿表上》：「御史大夫，秦官，位上卿，银印青绶，掌副丞相。」《通典·职官典二》：「秦无司空，置御史大夫以贰于相。」）与战国时列国普遍设置的负责记录与档案管理的御史不同，秦国的御史专掌纠察百官，是中国古代专门监察官制度的发端。御史大夫属官有两丞，一为御史丞，为大夫之副；一为御史中丞。其中御史中丞因为统领侍御史和诸郡监御史，可以命令御史按章纠弹百官，权力尤重。
九卿
九卿仰丞相政令，分掌国事。九卿之属有负责皇室事务的如奉常，有负责国家政务的如廷尉。奉常奉常，掌宗庙祭祀礼仪（《通典·职官七》：「奉常，周为春官宗伯，掌邦礼，秦改奉常。」），银印青绶、秩中二千石（九卿皆同）。属官有负责宫廷音乐的太乐；负责太庙祭祀事务的太祝；负责皇帝饮食以及祭祀用食物供奉的太宰（与周朝的太宰不同）；负责管理巫医的太医；负责观察天时星象、兼皇家史官的太史；负责应皇帝诏命进行卜筮太卜。郎中令郎中令，掌殿中议论、宾赞、受奏事、宫廷宿卫之事（《秦会要》：及主诸郎之在殿中侍卫，故曰郎中令）。郎中令的属官有负责议论的大夫；负责宾客迎送、接受群臣奏事的谒者；供奉宫廷、等待受职的诸郎；以及期门、羽林等禁卫军。大夫大夫，为专门的谏议官，无定员，有谏议大夫、太中大夫、中大夫、谏大夫等各类官称（《齐职仪》：秦置谏议大夫，掌议论，无常员，多至数十人，属郎中令）郎郎，为待选之官，有评议国事的议郎、有陪侍皇帝车驾的中郎、侍郎等，无定员，除授常达千人之多。案《汉书·百官公卿表》，议郎，中郎秩比六百石，侍郎秩比四百石，郎中秩比三百石。中郎分统于五官中郎将、左中郎将、右中郎将，郎中分统于车郎中将、户郎中将、骑郎中将。郎一般取自公卿等官僚子弟，一方面作为皇帝的扈从，一方面学习政务，是秦汉之际出仕的重要途径。谒者谒者，掌殿廷朝会礼仪、接受臣民章奏。置七十人，秩六百石。秦朝的谒者也常常作为朝廷的专使出外处理临时公事。仆射仆射，原为战车上的射手。秦朝则侍中、尚书、谒者、博士等官署皆置，为本署副长官，长官为令。《太平御览》卷二百零一：「秦汉之世，委政公卿，尚书之职，掌封奏，令赞文书，仆射主开闭，令不在，则仆射奏下其事。」卫尉卫尉，掌皇宫诸门屯兵。属官一巴士司马令，凡吏民上书、四方贡献、朝廷征召等，按法律要使用公家的车马，巴士司马令即掌其事；属官二卫士令，统领诸宫门卫兵。太仆太仆，本周朝官职，秦朝沿置，掌皇家车马。赵高出任郎中令之前任此职。廷尉廷尉，最高司法官。属官有廷尉丞。廷尉署有狱，称廷尉狱，大臣有罪则下廷尉狱。典客典客，掌诸侯与少数民族部族首