有一天，上帝来到你面前：“我最近搓了一个新的星球，准备在上面养几个小动物。但是我这几天有点忙，设计DNA这点小事就就交给你了。要是做好了，以后你就是这个星球的，嗯，球长。”压抑着第一次设计生命的激动，你挽起袖子，说干就干。你知道DNA要包含基因，基因用来生产蛋白质，所以你列出了动物们所需要的所有蛋白质，把它们的信息一一记录在DNA中。同时，你还聪明的想到了用特殊的编码来标注基因片段之间的边界。为了让动物能够进化，你还给予了DNA在复制过程中变异的能力。“我真是太机智了”，你在封面上写下《DNA蓝图1.0》，把设计图交给了上帝。上帝看了半天，抽出一张图纸，说：”这个刺猬如果生活在一个没有天敌的环境中，刺就没有用了。我希望它的刺可以退化掉。你需要哪些基因变异才能做到？“你信心十足地指着图说：“没问题，只要制造刺的角质蛋白的基因坏掉就可以了。在这里。”上帝皱着眉头说：“这样啊，它的爪子也没有了”。你说：“......“。上帝抽出另一张图纸，说：“这条鱼以后会进化成陆生动物，它的鳍可以变成脚吗？”你说：“......““这头鹿在干旱的时候需要吃高处的树叶，什么样的基因变异可以让它的脖子变长？还有这只鸟，它的细长嘴是用来捉虫子的吧？在虫子不多的地方，能不能变得粗短一些，可以敲坚果？“正在你苦苦思索短脖子和长脖子有什么蛋白质上的差异的时候，上帝又说：”这种白马，我觉得身上长一些黑色的条纹比较好看，最好每匹马的条纹都不一样。””可是这到底有什么用？“在崩溃前，你嘟囔了一句。”用处嘛，也许，哦，对了，它的天敌眼力不太好，可能是色盲。一大群这样的马跑起来可以晃花它的眼睛。”上帝把图纸扔给你，扬长而去。幸好你有一个程序员朋友。你请他吃饭，并把你的难题告诉他以后，他哈哈大笑：“果然是隔行如隔山。不是我打击你，你犯了一个很低级的错误。这个系统已经够复杂了，还要考虑系统升级和用户需求变化，你怎么用了一个单层的逻辑结构？”你眼睛一亮，给他斟了一杯酒，“愿闻其详。”“首先你要有一个底层函数库，用来做直接和硬件交互的工作。每一个函数都有自己特定的功能，逻辑要尽量简单。在这一层上面，你可以实现一些复杂的控制算法，由于有了底层函数库，你在设计控制算法的时候就不需要考虑硬件细节了。如果算法很复杂的话，你可以考虑把它再分成多个层次。需要注意的是，第一，每一层都有自己明确的功能，第二，每一层都只能调用自己下面那一层，第三，每一层要定义好自己对上层的服务接口。其实这也不是什么高科技，计算机的操作系统和网络协议都是这么设计的。你看，这个是ISO/OSI的七层网络协议。“”七层？好像多了点。“你吓了一跳。“是多了点。这只是一个参考模型。真正的网络没有这么多层的。另外，一个系统不能是硬编码的。你必须提供一个参数配置的接口，让同一个系统可以在不同配置下完成不同的工作。”回去后你苦思良久，最后决定把DNA设计改成三层结构。底层是直接控制蛋白质合成的基因。第二层是开关逻辑，可以打开或关闭底层基因。此外，开关还可以控制底层活动的强度。第三层实现全局控制，通过操作开关来掌握整个身体的外形和内部功能。你把新的设计交给了上帝：“您看，这是《DNA蓝图2.0》。这次我用了这个三层结构，您老上次提出的需求都可以满足了。”“噢，说说看。”上帝说。“我们先来看这个刺猬。刺和爪子的生长由不同的DNA开关控制，他们都调用底层的角质蛋白生成基因。如果刺的开关在变异中坏掉，就能得到一个光溜溜的刺猬，但是爪子不受影响。“图片来自exoticpetinfo.wordpress.com“鱼鳍要变成脚就稍微复杂一点。鱼鳍已经