面对敌军超过三万的兵力，其中还有将近八千人的骑兵，同时阿古柏的步兵部队也是批量装备了俄国、英国提供的步枪，甚至还有部分米尼步枪。
所以边成勋在决战中采取了先守后攻的战术，利用阿古柏所部不熟悉后装步枪的巨大战术优势，前期示弱，露出左翼只有三千人不到的弱点引诱阿古柏的骑兵冲击第六军的左翼。
随后边成勋仅仅是用左翼三千余步兵组成的防线，利用后装步枪的射速形成密集的弹幕，一举击溃了向他们发起侧翼冲锋的六千多敌军骑兵。
稍候边成勋以正面主力压上，依旧通过密集的后装步枪火力，一战击溃了阿古柏所部的主力部队。
此战第六军歼灭以及俘虏至少上万人，顺手还收复了迪化。
九月下旬，第六军的前锋部队顺利收复乌苏，进入到伊犁附近！
但是在这个时候，中华军却是和俄军发生了大规模的武装冲突！
俄军拒绝从伊犁撤出，所以前线率军的边成勋毫不犹豫的就是把阿古柏扔到一边，直接率军发起了进攻。
盘踞在伊犁的俄军数量虽然不少，但是也绝对多不到那里去，总兵力五千人不到。
仅仅是交战两天后，俄军就是伤亡超过千人，眼看不敌，而且俄军的后勤补给以及援兵又是遥遥无望，所以俄军将领无奈之下只能是率军主动撤退。
收复伊犁后，边成勋派遣了大约五千人北上继续追击俄军，并前往收复伊犁西部、塔尔巴地区等。
而他自己继续率领第六军主力部队约一万多人南下！
等到了1860年临近结束的时候，边成勋的兵锋已经抵近喀什。
进军途中，第六军和阿古柏的部队也是发生了多次交战，但是面对已经全面装备后装步枪的第六军，他们虽然有着俄罗斯人和英国人支援的火枪，但是依旧是不敌中华军。
要知道，现在英国人和俄罗斯自己都只能用米尼步枪而已，面对装备了后装步枪的中华军都打不过，更别说阿古柏的部队了。
如果不是受到补给线实在太长，估计边成勋早在1859年就杀进喀什了。
此外，进入1860年下半年后，帝国已经是结束了云南、四川方面的战事，压力可以说是大大降低，目前只需维持新疆、乌台省（外蒙古）、外兴安岭地区的战事而已，而且乌台省以及外兴安岭地区的战事以小规模为主，根本就没有什么大规模战斗，对后勤的压力比较小。
也就是说，进入1860年下半年之后，帝国可以全力供应第六军在新疆方向的战斗。
不过现在的两万人也是帝国后勤能力的极限的，这么多兵力打仗，炮弹，子弹都需要从遥远的江南地区运输过来，甚至连粮食都需要在陕甘地区征集然后千里迢迢送过去，维持这么一条补给线的花费实在是太大。
现在两万人就已经很勉强了，再多的话根本无法维持！
十二月二十七八号，第六军对重兵把守的喀什发动大规模总攻，经过两天激战后，第六军成功杀入喀什城并在当天把阿古柏的顽抗兵力逐出城区。
1861年一月一号，西历新年的第一天里，边成勋就是骑着自己的战马踏上了喀什城的土地！
喀什乃是新疆西南部的重镇，也是阿古柏盘踞新疆的核心战略支撑点，收复该城后基本上已经可以判定初步摧毁了阿古柏，剩下阿古柏的些许残兵已经不足为患。
又是经过了两个月的清剿作战后，边成勋所属的第六军成功歼灭了残留在新疆境内的阿古柏所部，彻底收复南疆地区。
于此同时，俄罗斯的数千人也是被驱除