将那倔强的郑秀研安顿好，郑成功终于静下心来思考体制的问题。
随着郑成功大力向海外扩张，提倡海上贸易，组建工厂制造，治下慢慢由封建小农经济向大量强占殖民地土地，以农奴的劳役经营商品生产性的大庄园，初级资本主义经济发展。
经济基础决定上层结构！
封建经济基础开始瓦解，在此基础上建立的封建****主义中央集权的上层结构下的三省六部制越来越不适应经济的发展了。
为了适应经济基础，提升工作效率，郑成功决定改制大明的内阁六部制。
大明内阁六部制中吏部：又称天官，掌管全国文职官吏的任免、考课、升降、调动、封勋等事务；
户部：又称地官，掌管全国土地、户籍、赋税、货币、官员俸禄、财政收支等事务；
礼部：又称春官，掌管国家的典章制度、祭礼、学校、科举和外事活动等；
兵部：又称夏官，掌管全国武官选用和兵籍、军械、军令、驿站等事务；
刑部：又称秋官，掌管国家的法律、刑狱等事务；
工部：又称冬官，掌管各项工程、工匠、屯田、水利、交通等政令。
内阁一开始是皇帝咨政机构，此后权力逐渐增大，后形成为明朝行政中枢，位于六部尚书之上。
然而，虽然首席内阁大学士（或称内阁首辅）有票拟的权力，但却不得不依赖于内部太监送达批红，这种内廷、外廷相互制约，时常造成了内外两大政治势力的争权夺利，以致明代成了宦官为祸最烈的朝代。
郑成功多方思考，以及参考中外历史，决定改良内阁六部职责。
首先是细化六部的职责，吏部分化为组织部、人力资源部；
户部分化为财政部、民政部、农业部、工商管理部；
礼部分化为外交部、教育文化部、卫生部；
兵部分化为国防部；
刑部分化为司法部、公安部；
工部分化为工程建设部、水利交通部；
御史台（都察院）分化为检察院、立法院，
在细分六部职责的同时，郑成功加强了内阁的权利。
虽然郑成功有开府之权，但只有任命自己府下六部的权利，无权任命内阁大学士。
连嘉奖自己的老师钱嫌益，也只能上报永历帝，由他下旨册封。
郑成功继续保持内阁制，只是名称上不再是内阁大学士，而叫内阁大臣。
内阁人数也增加了十五人，郑成功自任命为内阁总理。
每个内阁大臣主管一部，工作时，由内阁大臣汇报政务，然后由郑成功决策审配，再将结果送达各部门执行。
制度的改革，总是会让一部分人受益，同时也会让一部分人利益受损。
为了能让自己的改制顺利执行下去，郑成功派人将姚启圣、洪旭、林习山、卢若腾、曾樱、王忠孝等人请到自己府上。
郑府书房内，郑成功将自己写的改制内容分化给在座的几个人。
姚启圣、洪旭几个人看过后，分析着其中的轻重，一时间不敢开口。
王忠孝最重祖训，他站起拱手喝道：“大将军，忽设新司有违朝廷之法度、不合祖宗之法，不可行！”
对于王忠孝的反对，郑成功早有预料，没有在意，他看着姚启圣、洪旭、林习山等人。
枪杆子出政权！
有了军方的支持，就算王忠孝几个人反对，郑成功都敢强制执行改制。
洪旭和