陈守序走下南海号的艉楼甲板，如果从最高处的甲板算起，他要回到司令舱需要下3层楼梯。南海号能被选为旗舰，正是因为这艘马尼拉大盖伦有足够的空间容纳他的司令部军官。
南海号主桅后的露天甲板建起了第一层艉楼，靠近船尾的地方是第二层艉楼，两层呈阶梯状。第一层艉楼的尾舱住着船长和他的舰上军官。如果按照西班牙人的习惯，在舰长的楼上，更小的第二层艉楼中住的一般是舰上的领航员和税务官。陈守序这次出征，除了舰队官兵，还带了几位学者和超出编制的医生，现在他们住在第二层艉楼里。
陈守序的司令舱位于露天甲板下的炮甲板尾舱，外面的船尾还有一层突出舰体的游廊，也是舰队司令专属空间。
天气好的时候，陈守序会去游廊透透气。
炮甲板下是一层多功能甲板，部分士兵住舱、厨房、帆布贮藏室、医院等都在这一层。再往下一层是弹药库和货仓。
比较特殊是陈守序司令舱的脚下，因为此时马尼拉大盖伦还有明显的舷弧，船尾的层高比船首高出一截，因此在陈守序脚下就有个约占船长五分之一，多出来的一层。船舵在这里通过舵柄接入船内。这层还装备着2门9磅尾炮和4门9磅舷侧炮。高海况下，该层的炮门很可能无法打开。
南海号完成改装，彻底变成一艘战舰后。炮甲板单舷有10门大炮，其中4门18磅炮，6门12磅炮。露天甲板单舷7门9磅炮。船头两侧还有伸出舷外的2门9磅炮。
除了重炮，南海号在艉楼和船艏一共还有14门回旋炮。
整艘战舰一共有40门大炮和14门回旋炮。船上空间很宝贵，除了司令，包括船长在内的军官吊床都位于大炮上方，平时要与大炮睡在一起。
陈守序掀开分隔士兵和军官舱的布帘，绕过会议桌、吊床和12磅炮，回到自己的办公室。身为专职提督的好处，就是他不用像以前一样带班了，日常航行中闲暇比较多。为了不浪费这段时间，他会抽空给旗舰和参谋部的军官们上课，主要是一些数学和自然科学方面的基础知识。明天主要讲三角函数，他还得备课。
办公桌上点着两根牛油蜡烛，光线只能说一般。牛油蜡烛是在南美买的，还剩一点存货。
金城的鲸油储备已经告罄，现在各船更换船底得使用木焦油为主的黑料。他这次带梅尔维尔号出征，也有捕鲸的目的。只有一艘捕鲸船肯定不够，在陈守序离开金城之前，两艘双桅纵帆捕鲸船已经在设计之中。像梅尔维尔号一样，炼油炉也安放在船上
陈守序沉浸在中学数学公式中，忘记了时间。
直到门外响起杂乱的脚步声，有人敲门。被打断思路，陈守序稍微有些烦躁，他往烟斗里装了些烟草，凑到蜡烛前点燃。
烟草是最重要的作战物资之一，在自种的烟草尚未收获之前，金城还得依赖从暹罗进口的烟叶，不过这个问题快要解决了。陈守序在研究院搞出来的植物苗圃的重要性没多少人理解，士兵们最关心的是烟草种植园和酿酒作坊，这两项工作不需要陈守序亲自抓，本身推进的就很快。
“进来。”
首先推门进来的是蔡元定，他也参与了刚才的救援行动，雨水混杂着海水，全身湿透。
在他身后是一位梳着发髻的华人。陈守序上下打量了来者两眼，海难之后的样子当然好不到哪去。帽冠不见了，现在发髻用的是根白色的带子束起。身上是浅黄色对襟宽袖直掇，脚穿翘尖布鞋。
看的出来，来人进门前整理过衣服，短短时间状态已经恢复的不错，如今也只是稍微有些狼狈。这是一位富家绅士，身材修长，略显瘦削。凌乱的衣衫遮不住