足利义辉在安抚一下六角义贤后就目送他离开，之后谦信就立即对足利义辉说：“京公方殿，占据京都的伊势贼众就交由臣下来解决，您重掌幕府大权只是时间问题。上杉家永远是幕府之臣。”
足利义辉听完谦信这番话后就非常高兴，当即表示：“余得上杉氏之助，离号令天下大名的日子就不远了。”
永禄元年九月四日。就当六角义贤前脚离开坂本城的同时，后脚伊势贞孝就率军三千占据了二条御所周边各地，山城国各关卡要道全部部署了自家军势。他就在灵山城内坐镇等候着足利义荣的到来。
不过，天有不测风云。伊势备中守入道的交涉失败了。足利义荣的马廻众细川骏河守、畠山伊豆守等纷纷反对。他们都劝谏足利义荣不要做傻事：三筑都不支持伊势家，还派松永久秀去拦截去援助伊势家的畠山军，这说明了什么？三筑都反对他们！若是我等就这样进入京都，那么伊势家失势后我等连阿波都待不下去了。
足利义荣也不是傻子，这话他还是听得明白的。他很清楚自己现在为什么还能在阿波住着，有人养着。要不是有三好家把他当“将军候补”养着，自己什么都不是。现在听伊势家的去京都继任将军，那么有几成把握是能当上将军的？更别说伊势贞孝并不能摆平朝廷方面。足利义荣可不想现在就圈铺盖走人，好日子他都没享受够。
足利义辉倒是把指挥大权都交给谦信，他先送了两把太刀给从丹波赶来的川胜继氏和小畠国明，还将他们作为明智光秀的与力。日后让明智光秀介入丹波和三好家在丹波的旗头松永长赖（内藤宗胜）抗衡。足利义辉在这次伊势贞孝的谋逆已经完全失去了对伊势家的信任。曾经的伊势家不管好坏都为了幕府的财政而东奔西走，而伊势贞孝继任后伊势家再也没有给幕府带来更多的财富。然而伊势贞孝要的是独揽大权，他迟早都要和足利义辉撕破脸皮。足利义辉原本是也不想那么早就和伊势贞孝撕破脸皮，毕竟消耗的都是幕府的实力，现在简直是完全让三好长庆在看自己的笑话。
足利义辉已经想好了新的政所执事人选——上杉谦信。反正她的领国离京都那么远，作为她在这段时间出生入死的奖赏，给这样的一个虚职也是应该的。至于帮自己和幕府干实事的活就让明智光秀来担任政所执事代即可。反正明智光秀就是被上杉家派来为幕府效力的，加上他又没有想要独揽大权的野心。
好在谦信将西近江的战事迅速结束，并且在六角家重新降服府后准备对盘踞在山城国南部的伊势家动手。
然而，身为幕府管领的细川晴元倒是在一边作壁上观。他丝毫没有出兵协助任何一方的想法。毕竟他已经没有足够的能力去干预任何的战事。三好长庆几乎将京兆细川家在京畿的大部分势力摧毁殆尽。他根本不想失去在山城最后的那么点领地。
就当谦信都将川胜、小畠、明智三部的兵力集中起来时，中西次郎坊来到了坂本城内。
“御馆大人，武田军已经出兵攻入了飞弹，姊小路家完全抵挡不住。而加贺、能登两国的净土真宗信徒已经集结了两万余准备伺机攻入越中。形势万分紧急！直江大和殿、本庄美作殿、加地骏河殿等大人都希望您火速返回越后！”中西次郎坊倒是没在意一旁庭院里练剑的足利义辉，直接对着大广间内的谦信大声汇报道。
“你说什么？！”谦信一把将手中的折扇瞬间捏成两半，顿时坐在大广间内的明智光秀、川胜继氏、小畠国明、淀川三右卫门等人都看得是清清楚楚。而在庭院里练剑的足利义辉此刻也停了下来。
“御馆大人，越中方面我方总兵力不足两万。如果三面夹击的话就算是有柿崎和泉殿、宇佐美骏河殿等坐镇越中，还是难以抵挡三面的同时攻击