水、积雪融水和冰川等，多年平均径流量100多亿立方米，占阿尔泰地区总径流量89%，注入斋桑泊，最后流入北冰洋。
乌伦古河，支流在山区，山前为散失区，全长573公里，最后归宿于乌伦古湖(布伦托海、福海)，在二台站以上，流域面积为2.2万平方公里，补给来源亦以冬季积雪为主，多年平均径流量11亿立方米。
两河上游多峡谷和断陷盆地，落差大，水流清澈，含泥沙少，水力蕴藏量约50万千瓦，目前开发利用较低。
植被与土壤3000～3500米以上植被为苔藓类垫状植物；2600～3500米为高山-亚高山草甸草原；1300～2600米为森林草原带；800～1300米是灌木草原；植被分布下限由西向东升高，如森林下限为1200～1900米，灌木草原下限为500～1500米，荒漠上限则为500～1100米。
土壤由高到低，主要分布有冰沼土、高山草甸土、亚高山草甸土、生草灰化土、灰色森林土、黑钙土、栗钙土、棕钙土等。
阿尔泰山的自然资源丰富多样，有多种矿藏和优良牧场，尤以森林资源中的优质木材在全疆占有重要地位，水力资源亦蕴藏充沛。
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