止对后两类中央军势力进行转化。尤其是第三类，更是最高当局在整编时的重中之重。
手段则还是老一套，掐头去尾，这套方法从军阀混战用到现在，最高当局已然是驾轻就熟。
“去尾法”针对的主要是普通士兵，对作战中损失较大的第三类中央军，往往军事委员会一纸命令就强行整编，趁着打败仗之后员额不足将这些部队从一个军编成一个师或几个团再编入黄埔系把持的基本部队。或者更直接地破坏建制打散后直接进行消化。从淞沪到武汉，这一路上最高当局没少消化地方部队，很多中央军因为甚至会在撤退时有意裹杂地方部队的溃兵，他们已经将杂牌军当成了补血的道具。
“掐头法”则需要耍些手段，顾名思义就是把部队的头脑去掉，由于过去的旧部队大多是私人部队，头脑一去，部队基本上群龙无首，只能听任摆布。掐头法也分文明和不文明两种，文明的是使用各种委任状将高级军官升个闲职调离；不文明的就是找个罪名、比如军纪败坏、贪污腐化、作战不力之类(这些罪名很大程度上还真不是捏造的)，把主官弄走，部队自然就被消化。
截止1938年10月底，最高当局指示军事委员会从溃败的部队中编出尉、校、将级军官达1.8万多人，然后将这些人全部调去以学习为名加以集中管制。仅长沙、重庆、西安三处的所谓“中央军官训练团”，就集中了中将、少将级军官200多人。这些人大部分都曾为北伐出过力，流过血，现在却被最高当局统统打入了冷宫。
按照最高当局的计划，黄浩然受伤中毒入院，这就省去了掐头的功夫。而在救援黄浩然的行动中，第25集团军所属的非中央嫡系部队表现不佳，刚好可以借题发挥，成为去尾的理由。
像99师、139师、188师这些黄浩然的基本部队只需要加强政治工作，把内部的青年军官团体打掉就可以了，这样程度的整改黄浩然应该接受，也必须接受。
军统和政治部的重点，将放在55军、27军，还有100军中的川军121师这样的第三类部队身上。先利用军官训练团的名义，将原有的军官调走一部分，混入新的黄埔系军官。然后再使用作战不利的罪名，取消旧的番号，将官兵打乱重分，分散到嫡系中央军当中。